El módulo de gestión de proyectos es necesario ya que no se pueden poner en la línea de salida todas las ideas y señales captadas, sino los conceptos de negocio ya que son más prometedores.
Debe existir un balance de recursos y proyectos definido, ya que no se puede dotar a todos los proyectos con una parte de los recursos y esperar a ver qué pasa; muchos proyectos estarán sobre-financiados y al contrario.
El módulo de Gestión de Proyectos tiene como objetivo recoger la información y establecer el portafolio de proyectos de innovación, y posteriormente establecer las fases y estado de desarrollo de los proyectos de innovación.
El portafolio de proyectos saca a desarrollo los proyectos más convenientes para la organización y más oportunos, aquellos que ofrecen un balance entre esfuerzo y resultado. Eso incluye la idea de que también debe haber un balance entre los proyectos en desarrollo de forma que el medio y largo plazo estén presentes. Después es absolutamente necesario tener control de los proyectos, sus hitos, sus puntos de decisión, para establecer una estrategia que consiga un "valor comercial esperado" acorde al esfuerzo realizado.